MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl32

Total Repeats: 458

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011264	TAT	2	6	49	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
2	NC_011264	TAA	2	6	102	107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
3	NC_011264	T	6	6	118	123	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
4	NC_011264	TCC	2	6	210	215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288889
5	NC_011264	AATTT	2	10	216	225	40 %	60 %	0 %	0 %	203288889
6	NC_011264	CAA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
7	NC_011264	ATTA	2	8	316	323	50 %	50 %	0 %	0 %	203288889
8	NC_011264	TC	3	6	325	330	0 %	50 %	0 %	50 %	203288889
9	NC_011264	CTA	3	9	348	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
10	NC_011264	CATT	2	8	360	367	25 %	50 %	0 %	25 %	203288889
11	NC_011264	TTGT	2	8	389	396	0 %	75 %	25 %	0 %	203288889
12	NC_011264	T	6	6	412	417	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
13	NC_011264	TCT	2	6	434	439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288889
14	NC_011264	TTCT	2	8	441	448	0 %	75 %	0 %	25 %	203288889
15	NC_011264	AATAA	2	10	468	477	80 %	20 %	0 %	0 %	203288889
16	NC_011264	TTA	2	6	491	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
17	NC_011264	TCA	2	6	497	502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
18	NC_011264	TAA	2	6	604	609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
19	NC_011264	TTA	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
20	NC_011264	TCC	2	6	682	687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288889
21	NC_011264	TAC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
22	NC_011264	T	6	6	694	699	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
23	NC_011264	T	7	7	724	730	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
24	NC_011264	TCA	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288889
25	NC_011264	ACA	2	6	758	763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
26	NC_011264	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
27	NC_011264	ACA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288889
28	NC_011264	A	6	6	791	796	100 %	0 %	0 %	0 %	203288889
29	NC_011264	TAT	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288889
30	NC_011264	AAT	2	6	821	826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
31	NC_011264	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288889
32	NC_011264	TAAA	2	8	870	877	75 %	25 %	0 %	0 %	203288889
33	NC_011264	T	6	6	878	883	0 %	100 %	0 %	0 %	203288889
34	NC_011264	CT	3	6	3586	3591	0 %	50 %	0 %	50 %	203288890
35	NC_011264	CTT	2	6	3603	3608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
36	NC_011264	TTAA	2	8	3644	3651	50 %	50 %	0 %	0 %	203288890
37	NC_011264	TGC	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
38	NC_011264	CTG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
39	NC_011264	CTT	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
40	NC_011264	TCC	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
41	NC_011264	CTG	3	9	3786	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
42	NC_011264	CCT	2	6	3833	3838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
43	NC_011264	CAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
44	NC_011264	ATT	2	6	3914	3919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
45	NC_011264	TCT	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
46	NC_011264	CTG	2	6	3945	3950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
47	NC_011264	TAT	2	6	3955	3960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
48	NC_011264	CTG	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
49	NC_011264	CTG	2	6	3999	4004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288890
50	NC_011264	ACT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
51	NC_011264	T	7	7	4135	4141	0 %	100 %	0 %	0 %	203288890
52	NC_011264	T	6	6	4292	4297	0 %	100 %	0 %	0 %	203288890
53	NC_011264	TTG	2	6	4332	4337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288890
54	NC_011264	TTA	2	6	4385	4390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288890
55	NC_011264	CTT	2	6	4490	4495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288890
56	NC_011264	TCC	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
57	NC_011264	TCC	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288890
58	NC_011264	TTCC	2	8	4548	4555	0 %	50 %	0 %	50 %	203288890
59	NC_011264	CAT	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
60	NC_011264	CAT	4	12	4591	4602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288890
61	NC_011264	AAT	2	6	4604	4609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288890
62	NC_011264	T	6	6	4633	4638	0 %	100 %	0 %	0 %	203288890
63	NC_011264	ATTC	2	8	4645	4652	25 %	50 %	0 %	25 %	203288890
64	NC_011264	TC	3	6	4878	4883	0 %	50 %	0 %	50 %	203288891
65	NC_011264	TTAT	2	8	4892	4899	25 %	75 %	0 %	0 %	203288891
66	NC_011264	TCTAC	2	10	4916	4925	20 %	40 %	0 %	40 %	203288891
67	NC_011264	CTTA	2	8	4957	4964	25 %	50 %	0 %	25 %	203288891
68	NC_011264	CTA	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
69	NC_011264	TCC	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288891
70	NC_011264	ATCTTT	2	12	5083	5094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203288891
71	NC_011264	ATC	3	9	5116	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
72	NC_011264	T	6	6	5125	5130	0 %	100 %	0 %	0 %	203288891
73	NC_011264	AGC	3	9	5131	5139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288891
74	NC_011264	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
75	NC_011264	ATT	2	6	5179	5184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288891
76	NC_011264	AGC	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288891
77	NC_011264	CAT	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
78	NC_011264	TAG	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288891
79	NC_011264	AGC	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288891
80	NC_011264	CTT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
81	NC_011264	TCA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288891
82	NC_011264	TTC	2	6	5579	5584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
83	NC_011264	ATTT	2	8	5601	5608	25 %	75 %	0 %	0 %	203288891
84	NC_011264	TTC	2	6	5663	5668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288891
85	NC_011264	CAA	2	6	5715	5720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288891
86	NC_011264	ACC	2	6	5785	5790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288891
87	NC_011264	CAA	2	6	5803	5808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288891
88	NC_011264	ATT	7	21	5810	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288891
89	NC_011264	T	7	7	6024	6030	0 %	100 %	0 %	0 %	203288892
90	NC_011264	CTTA	2	8	6092	6099	25 %	50 %	0 %	25 %	203288892
91	NC_011264	CTG	2	6	6109	6114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288892
92	NC_011264	AAC	2	6	6131	6136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288892
93	NC_011264	ATT	2	6	6140	6145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288892
94	NC_011264	ACC	2	6	6173	6178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288892
95	NC_011264	TCC	2	6	6203	6208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288892
96	NC_011264	TAG	2	6	6262	6267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288892
97	NC_011264	AT	3	6	6310	6315	50 %	50 %	0 %	0 %	203288892
98	NC_011264	CTC	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288892
99	NC_011264	TGC	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288892
100	NC_011264	CTT	2	6	6362	6367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288892
101	NC_011264	ATT	3	9	6395	6403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288892
102	NC_011264	AAT	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288892
103	NC_011264	TCACA	2	10	6427	6436	40 %	20 %	0 %	40 %	203288892
104	NC_011264	ATC	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
105	NC_011264	TAC	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
106	NC_011264	CTA	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
107	NC_011264	GCACCA	3	18	6579	6596	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	203288892
108	NC_011264	CAG	2	6	6598	6603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288892
109	NC_011264	TAT	2	6	6665	6670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288892
110	NC_011264	ATTT	2	8	6694	6701	25 %	75 %	0 %	0 %	203288892
111	NC_011264	CAG	2	6	6703	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288892
112	NC_011264	GCA	2	6	6720	6725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288892
113	NC_011264	TTCTT	2	10	6732	6741	0 %	80 %	0 %	20 %	203288892
114	NC_011264	TTA	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288892
115	NC_011264	AAT	2	6	6811	6816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288892
116	NC_011264	CTT	2	6	6830	6835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288892
117	NC_011264	ATG	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288892
118	NC_011264	TTC	2	6	6902	6907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288892
119	NC_011264	TTC	2	6	6939	6944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288892
120	NC_011264	CTC	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288892
121	NC_011264	CTC	2	6	6964	6969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288892
122	NC_011264	CAT	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
123	NC_011264	CAT	3	9	6992	7000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
124	NC_011264	TAC	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288892
125	NC_011264	T	6	6	7043	7048	0 %	100 %	0 %	0 %	203288892
126	NC_011264	ATTC	2	8	7055	7062	25 %	50 %	0 %	25 %	203288892
127	NC_011264	ACTT	2	8	8449	8456	25 %	50 %	0 %	25 %	203288893
128	NC_011264	TC	3	6	8492	8497	0 %	50 %	0 %	50 %	203288893
129	NC_011264	TCC	2	6	8643	8648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
130	NC_011264	CCT	2	6	8674	8679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
131	NC_011264	T	6	6	8695	8700	0 %	100 %	0 %	0 %	203288893
132	NC_011264	AGC	3	9	8736	8744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
133	NC_011264	CAG	2	6	8750	8755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
134	NC_011264	TCTCAA	2	12	8768	8779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
135	NC_011264	CAA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288893
136	NC_011264	TCA	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
137	NC_011264	GCA	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
138	NC_011264	ACTA	2	8	8832	8839	50 %	25 %	0 %	25 %	203288893
139	NC_011264	CTA	3	9	8837	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
140	NC_011264	GCT	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288893
141	NC_011264	CTT	2	6	8873	8878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288893
142	NC_011264	CAC	2	6	8879	8884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288893
143	NC_011264	AGC	2	6	8895	8900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
144	NC_011264	AAT	2	6	8902	8907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288893
145	NC_011264	T	6	6	8918	8923	0 %	100 %	0 %	0 %	203288893
146	NC_011264	GCA	2	6	9034	9039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288893
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148	NC_011264	ATC	2	6	9078	9083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
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150	NC_011264	TATCT	2	10	9123	9132	20 %	60 %	0 %	20 %	203288893
151	NC_011264	TAA	2	6	9143	9148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288893
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153	NC_011264	TTC	2	6	9187	9192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288893
154	NC_011264	TAG	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288893
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156	NC_011264	CTC	2	6	9395	9400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288893
157	NC_011264	CAT	2	6	9414	9419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
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159	NC_011264	CAT	2	6	9435	9440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288893
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162	NC_011264	T	6	6	9468	9473	0 %	100 %	0 %	0 %	203288893
163	NC_011264	TTC	2	6	9485	9490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288893
164	NC_011264	CTT	2	6	12286	12291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
165	NC_011264	AGT	2	6	12294	12299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288894
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168	NC_011264	CTT	2	6	12368	12373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
169	NC_011264	CTT	2	6	12461	12466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
170	NC_011264	ATT	2	6	12549	12554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288894
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172	NC_011264	CAA	2	6	12576	12581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288894
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176	NC_011264	CTT	2	6	12737	12742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288894
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179	NC_011264	TCCT	2	8	12840	12847	0 %	50 %	0 %	50 %	203288894
180	NC_011264	ATT	2	6	12858	12863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288894
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186	NC_011264	ATTA	2	8	13135	13142	50 %	50 %	0 %	0 %	203288895
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231	NC_011264	TA	4	8	15558	15565	50 %	50 %	0 %	0 %	203288897
232	NC_011264	TTCT	2	8	15569	15576	0 %	75 %	0 %	25 %	203288897
233	NC_011264	TAT	3	9	15893	15901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288898
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242	NC_011264	T	6	6	16282	16287	0 %	100 %	0 %	0 %	203288898
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247	NC_011264	ATT	2	6	16631	16636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288899
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250	NC_011264	ATT	2	6	16730	16735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288899
251	NC_011264	TATT	2	8	16756	16763	25 %	75 %	0 %	0 %	203288899
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254	NC_011264	TAA	2	6	16819	16824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288899
255	NC_011264	TAAT	2	8	16828	16835	50 %	50 %	0 %	0 %	203288899
256	NC_011264	TTA	2	6	16836	16841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288899
257	NC_011264	CTT	2	6	16844	16849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288899
258	NC_011264	TAG	2	6	16876	16881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288899
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261	NC_011264	CAA	2	6	17030	17035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288899
262	NC_011264	A	6	6	17038	17043	100 %	0 %	0 %	0 %	203288899
263	NC_011264	ATA	2	6	17095	17100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288899
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265	NC_011264	CCT	2	6	17134	17139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288899
266	NC_011264	TAC	2	6	17180	17185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288899
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269	NC_011264	TCCT	2	8	17287	17294	0 %	50 %	0 %	50 %	203288899
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274	NC_011264	T	6	6	17489	17494	0 %	100 %	0 %	0 %	203288899
275	NC_011264	AAT	2	6	17611	17616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288900
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397	NC_011264	AGA	2	6	24532	24537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288905
398	NC_011264	GGT	2	6	24582	24587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288905
399	NC_011264	A	6	6	24592	24597	100 %	0 %	0 %	0 %	203288905
400	NC_011264	TGTT	2	8	27696	27703	0 %	75 %	25 %	0 %	203288906
401	NC_011264	A	6	6	27739	27744	100 %	0 %	0 %	0 %	203288906
402	NC_011264	TAG	2	6	27754	27759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288906
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404	NC_011264	GTA	2	6	27771	27776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288906
405	NC_011264	A	7	7	27792	27798	100 %	0 %	0 %	0 %	203288906
406	NC_011264	AGAA	2	8	27813	27820	75 %	0 %	25 %	0 %	203288906
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410	NC_011264	ATT	2	6	27926	27931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288906
411	NC_011264	TAT	2	6	28097	28102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288906
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413	NC_011264	TTA	2	6	28292	28297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288906
414	NC_011264	ATC	2	6	28321	28326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288906
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432	NC_011264	ATA	2	6	30114	30119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288908
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440	NC_011264	AATT	2	8	30487	30494	50 %	50 %	0 %	0 %	203288908
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455	NC_011264	GGATT	2	10	31305	31314	20 %	40 %	40 %	0 %	203288910
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